2002年，博阿滕加入了柏林赫塔足球俱乐部青训营。2007年8月，博阿滕转会至汉堡足球俱乐部。2010年6月，博阿滕转会至曼彻斯特城足球俱乐部。2011年7月，博阿滕转会至拜仁慕尼黑足球俱乐部。2012/13赛季和2019/20赛季，博阿滕追随拜仁慕尼黑两次获得赛季“三冠王”。 
2009年6月，博阿滕代表德国U21青年队夺得欧洲U-21足球锦标赛冠军。2014年7月14日，博阿滕代表德国夺得2014年巴西世界杯冠军。

2020年8月24日，2019-2020赛季欧洲冠军联赛决赛，博阿滕帮助球队以1-0击败巴黎圣日耳曼，夺得冠军。  2019-20赛季，博阿滕随队夺得德甲、德国杯、欧冠三座冠军，这也是他第2次随队获得三冠王。  

2021年1月21日，博阿滕完成了自己在德甲的第300场比赛。  5月22日，博阿滕完成了自己在拜仁的最后一场比赛。  博阿滕在2011年夏天从曼城加盟拜仁，一共为球队出场363次，总登场时间定格在了29619分钟，贡献了10球25助攻。在2013年欧冠决赛常规时间临近结束的时候，博阿滕用一脚长传精准地找到了里贝里，里贝里脚后跟一拨，跟上的罗本杀入禁区，打进了那粒决定性的进球。效力拜仁的10年时间里，博阿滕随拜仁夺得了两次三冠王，经历过弗里克、科瓦奇、安切洛蒂、瓜迪奥拉、海因克斯等五位拜仁主帅。

2021年9月1日，法甲里昂官方宣布博阿滕以自由身的身份加盟，双方签约至2023年